Das Hauptgebäude der Schule wurde 1905 als „Schule auf dem Stein“ erbaut und 1957, 1978 und 1983 bis auf die heutige Größe erweitert. Bis 1991/92 hieß die Schule POS „Ernst Schneller“, nach der politischen Wende wurde der Name 1992 in „Grundschule Waldkirchen“ geändert. Nachdem seit 1974 die Schüler klassenstufendifferent in 2 Orten beschult wurden (die Klassen 1 – 4 Teilschule Börnichen, in Waldkirchen die Klassen 5 – 10), erfolgte 1997 erstmalig die Einschulung einer 1. Klasse mit Kindern aus Waldkirchen und Börnichen. Ab 2002 wurden auch die Kinder aus Grünhainichen an dieser Schule unterrichtet.
Durch den Grundschul-Ersatz-Neubau im OT Grünhainichen konnte der Schulberieb in der neuen Grundschule „Im Grünen“ am 01.11.2022 erfolgreich aufgenommen werden.
Dort lernen nun alle Kinder des Verwaltungsverbandes Wildenstein (=der Gemeinde Grünhainichen mit seinen Ortsteilen Borstendorf, Grünhainichen, Waldkirchen sowie die Kinder der Gemeinde Börnichen) nun gemeinsam.
Das Objekt wurde in 2025 an Privat veräußert.
